一、团队简介
徐涛院士与何顺民研究员发起“女娲”中国人群基因组资源,第一阶段包含5000多例中国参考人群样本、超30X全基因组高深度测序数据,是已发表的唯一高深度测序中国参考人群全基因组队列。研究团队依托于中国科学院生物物理研究所,致力于构建并解析中国人群队列全基因组大数据。
二、研究方向
为服务国家重大战略需求,解析中国人群全基因组队列大数据,推动中国人群精准医学进展,“女娲”研究团队现招聘相关领域背景的博士后/助理研究员/副研究员/项目聘用人员2-3名,研究方向如下:
1. 基于“女娲”中国人群基因组数据,构建和解析中国人群遗传变异图谱;
2. 开展重大疾病的关联分析和精准医学研究应用;
3. 开发基因组数据分析算法,如变异鉴定解析、关联分析方法论等;
4. 其他相关工作。
三、招聘岗位及要求
(一)生物信息学/计算生物学方向
1. 获得博士学位,从事生物信息学/计算生物学研究3年以上,在国际学术期刊上发表过第一作者高水平SCI论文,具有独立工作能力;
2. 有用生物信息学方法研究人群队列、肿瘤/罕见病/慢性病等背景,熟知二代测序技术常用的生物信息分析软件和数据库;
3. 熟悉Linux操作系统和计算机编程,熟练使用C, C++, Java, Python, Perl, R中一种以上编程语言;
4. 责任心强,热爱科研,学风严谨,具有刻苦钻研精神,具备良好的沟通能力和团队合作能力。
(二)数学/计算机方向
1. 数学、计算机、自动化、人工智能等专业方向,硕士以上学位;
2. 具备统计、机器学习、神经网络等基础理论和算法知识,在机器学习和人工智能领域有实践经验;
3. 具有算法开发经验者优先;
4. 责任心强,有上进心,学风严谨,具有刻苦钻研精神,具备良好的沟通能力和团队合作能力。
(三)生物、医学等方向
1. 获得生物技术、医学、药学等专业的博士学位;
2. 有分子、细胞生物实验基础,或熟悉linux系统、会编程、有使用生物信息软件经验;
3. 对人类疾病方向的生命科学研究或临床产业转化有浓厚的兴趣;
4. 工作执行力强,富有责任心和良好的团队精神。
四、福利待遇
根据单位及国家相关规定提供薪酬及福利,社会基本保险按国家政策执行。具体待遇视个人研究背景和经历参考提高,优秀者待遇从优并可视情况提供正式编制解决户口。
五、招聘办法
请符合条件的申请者将个人简历、代表性论文的电子文本和三位推荐人的姓名及联系方式发至:haodi(AT)ibp.ac.cn(请将(AT)替换为@,防止垃圾邮件)。邮件主题栏内请注明“女娲项目团队应聘”。
经过初审后,我们将会通知应聘人员具体面试安排。招聘自本通知发布之日起,直至招满为止。更多信息请扫二维码联系我们。
女娲项目团队招聘启事
六、研究成果介绍
徐涛院士和何顺民研究员团队基于“女娲”中国人群基因组资源,首次发布中国大规模参考人群的SNP/Indel遗传变异图谱、移动元件变异图谱、微卫星序列变异图谱,以及中国人群特异的单倍型参考面板,被评为“中科院数据工作十大进展”,相关研究成果发表于Cell Reports,Nature Communications,Nucleic Acids Research等。
“女娲”基因组资源
(一)简单遗传变异图谱
2021年首次发布中国人群SNP/Indel变异图谱、基因及非编码基因功能丧失型变异图谱,以及首个中国人群特异的大规模高深度单倍型参考面板(Cell Reports, 2021),其中2500万变异为国际首次发现,被评为“中科院数据工作十大进展”,被认为是国际上对中国人群基因组数据分析最全面深入的研究。
成果报道:徐涛/何顺民团队发布"女娲"基因组资源,提供中国人群遗传变异图谱和参考面板
(二)可移动元件插入图谱
系统分析和挖掘了5675人的全基因组数据(含“女娲”中国人群数据2998例),发布全球人群移动元件变异图谱 (Nucleic Acids Research, 2022),鉴定了3.6万变异,其中2/3为首次发现,构建了含中国人群数目最多的全球移动元件变异资源,首次评估约9.3%的蛋白截断事件由移动元件插入导致。
成果报道:“女娲”基因组计划第2篇|徐涛/何顺民团队发布中国人群可移动元件插入变异图谱
(三)串联重复序列变异图谱
系统分析和挖掘了6487人的全基因组数据(含“女娲”中国人群数据3983例),发布全球人群的微卫星(短串联重复)序列变异图谱 (Nature Communications, 2023),鉴定了超过156万变异,其中1/3为首次发现,构建了含中国人群数目最多的全球微卫星变异资源,鉴定了数千个具有潜在基因调控功能的微卫星位点。